El EvaGreen ® esta diseñado trabajar en qPCR, de forma segura para el usuario.  Minimizar la interacción con el ADN en las células vivas. Resultados experimentales confirman que no traspasa los guantes de látex ni las membranas celulares. No es citotóxico ni mutagénico, ni en concentraciones muy por encima de las concentraciones de trabajo utilizadas en qPCR. Por otra parte, EvaGreen ® ha superado con éxito las pruebas de seguridad del medio ambiente de conformidad con el Título 22 CCR Caracterización de Residuos Peligrosos, una regulación ambiental en el estado de California. Como resultado, el producto de tinción EvaGreen ® no sólo es seguro de manejar, pero también puede ser convenientemente eliminados por el desagüe.